农民工工资个人所得税的计算公式=(月应税收入-5000)*税率-速算扣除数，具体是月度收入-5000元(免征额)-专项扣除(三险一金等)-专项附加扣除-依法确定的其他扣除。

不管是对农民工工资个人所得税进行计算，还是对其他劳动者工资进行个税计算，首先都要知道其工资是多少，只有那些达到了纳税标准的工资收入才需要缴税。

农民工受雇于企事业单位并签订一定期间的劳动用工合同，由支付人在发放工资时，按“工资、薪金所得”项目代扣代缴税款。