军籍生和非军籍生在待遇、毕业、身份等方面是存在一定的区别的，具体分析如下：

1、待遇：有军籍的学生可以享受军人学员待遇，没有军人身份的学员不能享受这种待遇。

2、毕业：有军籍的毕业后可以提干、根据学历授予相应的军官军衔，无军籍毕业以后没有工作分配，更不可能当军官。

3、身份：有军籍的身份是通过部队考学进入部队院校的现役军人，无军籍的身份是委培生，不是军人。