农村医疗保险在办理出院的时候，医院就会办妥医保报销，具体可以直接咨询医院结算窗口的工作人员。

凭结算发票单，农合证、身份证和户口簿原件及复印件，诊断证、住院者身份核对单、住院费用汇总清单到农合直补窗口报销，领取补助款。

需要注意的是，在报销过程中，不同地区和政策可能会有不同的报销比例和限制条件，因此在报销前最好了解当地的具体政策。