结构性存款是有50万保障的，存款超过50万的，最高可以获得50万的赔偿，存款不足50万的，实行全额赔偿。

需要注意的是，结构性存款的收益并不在存款保险制度的保障范围内，50万元以内的本金是有存款保险制度保障的。

结构性存款根据存款资金配置的不同有三种不同的类型，分别为本金保障+最低存款预期收益保证、本金保障和部分本金保障。这三种结构性存款类型的风险是依次递增的。