南京商业贷款能用公积金还款。商贷用公积金还款的途径如下：

1、把商业贷款转公积金贷款。因为商业贷款利率比公积金贷款利率高，把商业贷款转为公积金贷款可减轻借款人负担。

2、用公积金余额还商业贷款。

（1）直接提取。住房公积金余额部分能直接提取一次性归还贷款本金，这种方法一年只能提取一次，并且账户内需要留有余额，还贷后，贷款的本金减少，总的利息也相应减少了。

（2）委托提取。借款人办理冲还贷业务，每月银行划扣应还贷款。