车主卡是不影响卖车的。车主卡只是挂在用户的名下，而并不是挂在用户的车上的。

车在用户申请车主卡时是以用户的资产形式出现，其目的是让银行对用户的消费还款能力做出评估的依据，所以用户以后的用卡情况，和卖车没有任何关联的。

如果相关用户在卖车的时候对于自己申请过车主卡不是很放心，那么可以选择把车主卡进行注销，携带本人身份证和相关车主卡去网点柜台申请注销即可。