根据中国人民银行的统一规定，信用卡逾期一天所扣除金额为最低还款额未还部分的5%。例如用户的账单最低还款额为2500元人民币，但是直至最后还款期限，用户仍有100元人民币没有还，那么用户信用卡逾期一天所扣除金额为100*5%=5元人民币。

需要注意的是，如果是用户因为信用卡逾期上了征信，会对用户之后的贷款、借款等需求产生较大影响，所以若是用户没有办法按时还款，可以选择银行的最低还款额，并且办理分期服务，以此来减轻还款负担。