公司向社保部门申请退费。以下是流程：

1.缴费单位向当地社会保险征缴中心提出办理退费的书面申请。

2.造成重复缴费或多缴费的相关的业务凭据。

3.重复缴费或多缴费的有关财务缴费资料。

经审核可以退费的，缴费单位就可以办理退费手续了。