洪水冲走的汽车保险公司是会赔偿的。

被洪水冲走的汽车只要是买了车损险，在没有人为破坏的痕迹时，在一般情况下都是会进行赔偿的，而且一般情况下保险公司还是按照全损的情况对这类事故进行处理，但是处理前需要车主去洪灾发生地的公安局寻求公安机构开一张“车辆遗失证明”。