农行不明扣费可以通过以下方法来进行查询：

1、本人携带身份证及银行卡到银行柜台申请流水账打印，即可查询账户所有交易信息。

2、登录个人网上银行依次点击账户、本行账户、明细进行交易明细查询。

3、可以拨打95599人工服务进行查询。