深市与沪市的股票代码区别主要是在于二者股票代码开头的数字不同：

1、深市的股票代码开头里，“002”开头的是中小板，“00”开头的是主板，“3”开头的是创业板。而沪市所有的股票代码开头都是“6”，沪市所有的股票都是属于主板股票。

2、深市的B股代码以“200”开头，新股申购以“00”开头，配股代码以“080”开头，而沪市B股代码以“900”开头，新股申购以“730”开头，配股代码以“700”开头。