补卡扣款是指银行卡丢失后去补卡，银行会收一定的工本费，这个工本费是直接从卡里的余额里扣的。不过不同的银行，办理补卡收取的工本费不一样，具体你可以咨询一下，因为即使是同一家银行，不同的银行卡，收取的补卡费也不一样。比如说信用卡和储蓄卡，两种就不一样。