财付通协议付款是指通过财付通余额或财付通快捷支付进行付款。用户需要将财付通账户和银行卡绑定，支付具体流程为：甲方将应缴纳的业务费用提交主动收费电子交易指令。乙方收到电子指令后，按指令扣划甲方财付通内的账款，并记录在收费客户账户中。这样甲乙双方以及收费客户之间就能免于承担因费用金额产生纠纷的任何责任。