汽车被水淹了保险公司会赔偿，但是赔偿的范围需要根据被保险人的投保项目来定。首先被保险人需要有投保车损险，才能获得全赔。车损险为主险，涉水险为衍生险种，车辆需要投保车损险才能附加投保涉水险，这样即使保险车辆被水淹后因操作不当致使发动机损坏的，也可以得到保险公司的赔偿。