保险公司保函的责任主要是保险公司保证在被保险人出现保单合同中规定的保险事故后，对被保险人或受益人承担一定金额的经济赔偿等。保险公司的保函是保险公司对被保险人进行赔偿的证明材料，被保险人或受益人可以要求保险公司进行办理，保障自身权益。