办理新农合特殊病种需要携带的资料有特殊病种门诊治疗建议书、合作医疗证历本、病历、有关化验报告单、照片二张。参保户将以上资料备齐之后交给村部负责人或者社区负责人，由村(社区)合作医疗联络员审核后报镇合作医疗联络员，再由镇联络员送区农村医保结报中心进行报销。