上证指数和深证指数的主要区别有以下几点:

1.上证指数是指上海证券交易所股票的指数。深证指数是指深圳证券交易所的股票指数。

2.实际上上交所的历史要比深交所的历史悠久很多。而且上交所更能代表中国股市的一个整体的状况。上交所的指数代表的是中国股市主要板块中数量的各个指标，而深交所主要是创业板和中小板。

3.在两家股市成交的股票的代码也是不同的，在上交所成交股票代码开头是601、602和603，在深交所成交的股票代码开头是000、300。

4.在股票交易的最后三分钟，两个证券交易所计算收盘价的方式也是不同的，在上交所最后三分钟采用平均交易价格计算出收盘价，而深交所会选择集合竞价的规则产生收盘价。