农村合作医保进行报销的比例，按照病情的不同而不同。

第一种：大病补偿，也就是住院的病人一次性或者是全年累计的应该报销的医疗费用已经超过了5000元以上，可以分段进行补偿。比如说5001到10000是补偿65%，而10001到18000元补偿70%。

第二种：住院补偿。包括药费和一系列的辅助检查费用是限额200元的，如果是60周岁以上的老人住院的话，治疗费和护理费每天会补偿10元钱，限额200元。

第三种：在村卫生室就诊报销60%，在镇卫生院就诊的话是报销40%的。