新农合住院报销比例如下:

1、镇卫生院报销60%。

2、二级医院报销比例为40%。

3、三级医院住院报销比例为30%。

4、包括CT、X光透视、心电图等在内的辅助检查费报销限额200元。

5、按照国家标准，手术费最高报销额度为1000元。

6、60岁以上的老人在镇卫生院住院是，每天补偿10元，最高补偿200元。