南京地铁可以刷支付宝过闸机。

南京地铁开通支付宝扫码乘车的方法如下:

1、打开支付宝，点击首页的“付钱”;

2、点击付款页面下方的“乘车码”;

3、页面跳转后点击右上角的三个点，然后点击“全部卡片”;

4、在搜索栏输入“南京”并搜索;

5、然后点击“南京地铁电子卡”——“同意协议并领卡”即可。