全供和差供在单位经费来源、单位性质、经营性收入等方面是存在一定的区别的，具体如下：

1、单位经费来源：事业全供的工资和福利其经费由国家拨付，差供单位是财政负担该单位工资的60%-80%，其余部分由该事业单位自行筹集。

2、单位性质：财政全供的单位主要是执行国家公务的行政机关单位和公益一类事业单位，财政差供的单位主要是公益二类事业单位。

3、经营性收入：财政全供只能由财政拨款，无经营性收入，财政差供除了财政拨款，还可以由该事业单位自行筹集工资。