广州公积金贷款还款不一定在账户里扣。需要分为以下几种情况：

1、如果广州公积金贷款的借款人办理了逐月冲还贷业务，那么广州公积金贷款还款是在账户里扣，如果借款人前往公积金管理中心办理了按月提取自动扣款手续，那么贷款银行每个月就会在公积金账户中扣除余额用来归还贷款，如果余额不足，那么会再从还款账户中扣除。

2、如果广州公积金贷款的借款人没有办理逐月冲还贷业务，那么广州公积金贷款还款不是在账户里扣。