公积金贷款是自动从还款卡上扣。

需要注意的是，公积金贷款自动扣款的顺序是主贷人公积金账户，辅贷人公积金账户以及公积金贷款还款卡，只有三个账户里任意一个账户余额大于或者等于应还贷款本息，才可以成功进行扣款。意思就是，公积金贷款还款是能够办理自动扣款的，只要账户中有足够的余额，就可以每个月自动进行扣款。