南京公积金贷款不可以按年还款。

公积金贷款还款和普通贷款还款一样，按月进行还款，就是每月归还一次公积金贷款本金和利息。没有一年还一次公积金贷款情况。

若借款用户办理了公积金冲还贷业务，可以用公积金账户余额冲抵公积金贷款的本金，冲抵只能每年冲一次，但是在每月还款的过程中，借款用户都是用自己银行卡中的资金还公积金贷款本息。