公积金贷款还款不一定是扣公积金。分为以下几种情况：

1、如果借款人办理了公积金对冲业务，那么这种情况下公积金贷款还款是扣公积金的，公积金对冲业务有两种方式，即月冲以及年冲。月冲的意思是贷款银行每个月从借款人的公积金账户中扣除余额用来偿还公积金贷款；年冲的意思是贷款银行每年一次从借款人的公积金账户中扣除余额用来偿还公积金贷款。

2、如果借款人没有办理公积金对冲业务，那么公积金贷款还款不会扣公积金。