公积金贷款的还款由银行自动扣款。公积金管理中心不直接办理贷款业务，借款人审批通过后，由委托银行办理相关代收代放的业务。

借款人同委托银行约定还款账户，并办理该银行用于还款的借记卡，银行每月从该账户扣缴房贷金额，借款人只要保证还款账户资金充足即可。

除了从还款账户直接扣款外，首月房贷扣款成功后，借款人可以向公积金中心申请公积金余额月冲抵业务，即银行每月从公积金账户余额中扣除相关应应交金额。

公积金余额不足以偿还每月房贷的，借款人还可以绑定自己或家人的银行账户，用于银行扣款。