逾期还款是会影响公积金贷款的，用户在申请公积金时必须确保个人征信良好，个人征信出现不良记录时，通常是无法通过公积金贷款审核的。

如果是偶尔一次不小心逾期，而且逾期额度不大、短时间之内归还的话，还是可以申请公积金贷款的，但是贷款利率会被提高或者获批的贷款额度被调低。

不同银行对于逾期的相关规定也是有所不同的，建议在申请前先了解清楚，具体以经办行的实际规定为准。