公积金正在还款二套贷款是可以提取的，只要相关用户的公积金账户有足够的余额，且没有出现过逾期行为，那么就是可以提取的。

在还清第一套住房的公积金贷款后，购买第二套住房又申请了公积金贷款，借款人可以提取其住房公积金储存余额归还贷款。

产权人可以凭第二套住房的产权证、购房合同、购房发票，在产权证发放之日起6个月内，申请提取住房公积金。