建设银行公积金贷款还款日扣两次，在还款日扣款失败或者是扣款余额不足，那么通常是会在还款日发起第二次扣款的。

如果自动扣款的时候因为余额不足扣款失败的情况下，建行是会进行提醒的，用户在存钱进还款账户后，应及时打电话给银行，通知银行进行二次扣款。

建设银行的公积金扣款如果超过两次仍然还是扣款失败，那么就会算是逾期了。