公积金贷款还款在办理公积金冲还贷的情况下是从公积金卡里扣的，如果没有办理，那么通常是不会直接在卡里直接扣取余额的。

需要注意的是，积金贷款在第一个月还款是先扣银行卡上的钱，因为银行规定是要往还款卡里存够一个月的扣款金额，以便第一个月扣款。

公积金贷款可以从公积金账户扣，也可以从借款人的借记卡里扣，或者是借款人支付现金都是可以的，借款人可以选择适合自己的还款方式。