公积金贷款还款能在余额里扣。

如果借款人想用公积金余额归还公积金贷款，那么可以办理公积金对冲业务，有以下两种对冲类型：

1、如果办理的是公积金月冲业务，那么贷款银行每个月会从借款人的公积金账户中扣除每个月的还款额，如果扣完余额还不足以支付月供，那么就需要再从还款银行卡中进行扣除了；

2、如果办理的是公积金年冲业务，那么贷款银行会一年扣除一次余额来归还公积金贷款。