公积金贷款还款不一定是自动扣费。公积金贷款还款有以下两种方式：

1、借款人可以在贷款银行开立一个公积金贷款的还款账户，每个月将应该归还的贷款本金以及利息存入还款账户，贷款银行会在还款账户中自动进行扣款；如果办理了公积金对冲业务，那么银行会从借款人的公积金账户中进行扣款；

2、借款人也可以携带现金每个月前往银行进行还款。