分为以下两种情况：

1、如果还款人选择的是从自己的公积金账户中进行扣款，那么还款人办理公积金对冲业务即可，还款人办理了公积金对冲业务以后，系统会先从公积金账户中进行扣款，如果公积金账户中的余额不足，那么会从指定的银行卡里进行扣款。公积金贷款有主贷人以及次贷人，银行会先从主贷人银行卡里扣款；

2、如果还款人选择的是银行卡还款，那么银行会从还款人指定的银行卡中进行扣款。