支付宝公交卡用的是支付宝里的钱，扣费的顺序大抵是支付宝余额、支付宝账户绑定的银行卡、余额宝等，如果用户想要调整支付顺序的话，可以在设置里调整。

一般像支付宝这种扣费功能都是由保险公司全额担保的，所以说被盗风险通常都是很低的，但如有查实，赔付金额是没有上限的，所以用户可以放心使用。