1.估值方式。货币基金的估值方式是摊余成本法；短债基金估值方式是市价法。

2.收益和风险性不同。短债基金一般投资短期债券，收益相对较高，波动相对较大。而货币基金一般投资货币市场工具，大头是银行存款、存单、国债等，短期债券占比较少，收益相对较低，波动也小一些。

3.投资限制。短债基金的投资限制比较少，而货币基金投资标的信用等级、组合流动性等方面限制较多，但货币基金相对更加安全。