支付宝买基金和证券公司买基金的区别主要如下：

1、交易场所不同：在支付宝内购买基金为场外交易，在证券公司内购买基金部分为场内交易。

2、门槛不同：支付宝购买基金不需要特别注册账户，在证券公司购买基金投资者需要持有一个有效的账号才可以进行购买。

3、操作性不同：支付宝购买基金的操作性比在证券公司购买基金的操作性难度低。