助学贷款利息会自动扣除，学生毕业后，利息和本金一并还进支付宝里，到了还款日系统就会自动扣款，由于助学贷款每年的还款日是12月20号，最后一年是9月20号，在这之前需要本人在银行卡内提前存入归还金额，如若扣款失败会产生多余利息，还有可能进入失信名单。