两次审核的主体机构不同的。初审一般是银行进行审核的，而复审是由公积金管理中心进行审核。申请公积金贷款时，申请人应先向银行提出申请，并提交相关的资料，其中包括公积金缴存证明等，等银行审核通过后，再将这些资料上报给公积金管理中心，由其进行复审，复审通过后公积金管理中心就会通知银行，最后银行进行放款。