农村信用社和农商银行最主要的区别就是二者的企业性质不同。农村信用社是股份合作制企业，受省联社监管。而农商银行则是股份有限公司，受银监会监管。另外二者的规模也有区别，农村商业银行规模和实力一般都比农村信用社更大更强。