是不会影响征信的，因为在还款日的这一天，银行系统会对还款银行卡进行多次扣款，如果在这一天银行卡中还款的额度不够的话，系统会先扣除一部分，之后用户继续补足的话，系统就会继续扣，一直等到扣满房贷还款金额就会停止。由于扣款都是在还款日当天进行的，所以只要在这一天补上了，就不会对信用有什么影响。