农行工本费是在客户来办理开卡等业务时一次性扣除的，之后不会在二次扣除。工本费主要是在办理银行卡、存折、票据等其他业务时收取的费用。例如：一些银行卡的办卡费是5元。此外，存折挂失无论是定期存款还是活期存款，都将收取10元手续费。