农民办企业申请贷款的流程如下：

1、农民携带身份证、营业执照、户口本等资料，前往贷款银行提出贷款申请。

2、贷款银行根据申请资料进行审核与调查。

3、通过审核以后，农民和贷款银行签订贷款合同。

4、农民办理抵押登记等手续。

5、所有手续办理完成后，贷款银行发放贷款，农民支用贷款并按照合同约定还款。同时，贷款银行会对农民办的企业经营情况进行追踪调查和检查。