开了非恶意透支证明可以申请公积金贷款，而且只要你的逾期记录不连续超过3期，累计超过6期就可以办理公积金贷款。不过，有逾期记录肯定会对你办理公积金贷款有影响，影响的主要是你的借款金额和贷款期限，其他的没什么影响。

如果你想申请公积金贷款，可以按照下面的流程完成：

1.申请人到公积金中心进行咨询，提交所需资料;

2.中心进行审核然后告知是否可以办理贷款;

3.对担保中心的担保资格进行审核;

4.符合贷款条件的，双方签订借款合同;

5.中心把所有的资料，转到经办的银行审核;

6.审核通过后，银行放款。

有非恶意透支证明可以申请公积金贷款，不过，如果你的逾期次数过多的话，你这个证明可能就没有什么用了，因为公积金贷款对个人信用的要求还是比较严的。只有一两次逾期，这个证明才有用。

另外，想申请公积金贷款，还需要满足下面的条件：

1.具有完全的民事行为能力;

2.申请人具有稳定的收入，信用良好，有偿还贷款本息的能力;

3.公积金贷款用于购买、建造、翻建、大修自住住房;

4.具有购房的相关合同;

5.可以提供委托人认可的担保。