重庆购买二手房申请住房公积金贷款的流程是：

1、贷款申请人首先需要向贷款银行咨询，领取相关资料，并进行预审登记。

2、重庆买卖双方签订的《购房合同》。

3、贷款银行受理借款申请人资料，由重庆银行报公积金核心审批后，借款人与贷款银行签订借款合同及抵押合同等相关贷款文件。

4、房屋买卖双方到重庆房产局及土地局办理房屋“两证”交易过户手续。

5、由贷款银行或借款人到重庆房产局办理房屋抵押登记手续。

6、由公积金核心将贷款资金通过贷款银行直接划转到卖房方的存款账户内。

7、贷款发放后次月，借款人按《借款合同》约定偿还贷款本息，直至贷款全部还清。借款人较后一次还清剩余贷款时，应亲自前往重庆贷款银行并在银行柜面办理还贷结清手续。