商业贷款和公积金贷款的区别有：

1.他们的性质不同，公积金贷款主要以个人缴存的公积金为主，向缴存公积金的职工用于购买住房的住房保障型贷款，是一种政策性贷款，不一盈利为目的;而商业贷款是以房产等财产作为抵押物，向银行获得一次性借款的交易，是以赢利为目的。

2.它们的利率不同，公积金贷款的利率在5年(含)一下的期限，利率为2.75%，在5年以上，利率为3.25%。而商业贷款的利率普遍较高，在4%左右。

商业贷款和公积金贷款的区别挺大的，公积金贷款是缴存了公积金的职工的一种购房福利，不仅利率低，还款期限长，而商业贷款的利率就比较高了，没有公积金贷款划算。另外公积金贷款只能用于买房，建房，大修住房时使用，不能用于其他地方，而商业贷款就没有这些限制了。另外申请公积金贷款必须是缴存了公积金的职工才能申请，商业贷款所有人都可以申请。