夫妻双方公积金账户都办理公积金代扣业务，以一方公积金账户为主扣款帐户，当主扣款帐户扣款后还不足以偿还当月应还贷款本息时，就再扣另一方公积金账户余额;如果夫妻俩公积金账户余额累计不足以偿还当月应还贷款本息时，就不再“代扣”，委托人应在每月还款日前向还款储蓄帐户(申请贷款时提供的)存入能够按月足额划转的资金.

夫妻双方公积金共同还贷的申请操作方法是：首先去公积金管理中心签订一份夫妻共同还贷的协议,然后带好相关资料去银行办理手续即可,也可以委托办理公积金贷款的公司办理,付点手续费就可以了。