如果第一套是公积金贷款买的，在没还清贷款的情况下，是不能用公积金买第二套的。

申请公积金贷款的流程是：借款人申请住房公积金贷款需到银行提出书面申请，填写住房公积金贷款申请表并提供想换资料，需要提供的资料有申请人住房公积金缴存证明;申请人的身份证明如身份证，户口本等(若申请人已婚，则需要提供配偶的相关资料以及结婚证);家庭稳定经济收入证明及其它对还款能力有影响的债权债务证明;)公积金中心要求提供的其他资料。

　　银行会对申请人提供的资料进行审核，并及时报送公积金中心。公积金中心负责审批贷款，并及时将审批结果通知银行。

　　银行按公积金中心审批的结果通知申请人办理贷款手续，借款人签订相关合同或协议，并将借款合同等手续送公积金中心复核，符合通过后，等待放款。

这要看你第一套是公积金贷款买的还是商业贷款买的，若借款人在购买第一套房时，也是使用公积金贷款购买的，并且还未完贷款，则在购买第二套房屋时，就不能使用公积金贷款。

　　若第一套房是用商业贷款买的，并且正在按揭中，则第二套房可以使用公积金贷款，首付等规定以第二套房计算，即首付最低50%，利率上浮10%。

　　若第一套房的贷款已还清，无论是商业贷款还是公积金贷款，都可以用公积金贷款购买第二套房，相关规定自然也按照第二套来计算。